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簡(jiǎn)要描述:蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)之iTRAQiTRAQ:是一種相對(duì)和絕對(duì)定量的同位素標(biāo)記技術(shù),廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中。iTRAQ技術(shù)通過標(biāo)記蛋白質(zhì)或肽段,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的定量分析,從而揭示蛋白質(zhì)在生物過程中的動(dòng)態(tài)變化。
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蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)之iTRAQ
iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)是一種用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的同位素標(biāo)記技術(shù)**。這種技術(shù)使得研究者能夠同時(shí)對(duì)多達(dá)
8個(gè)不同樣本中的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)和絕對(duì)定量分析。iTRAQ技術(shù)自2004年由美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司推出以來(lái),已成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要工具。下面將進(jìn)一步探討
iTRAQ技術(shù)的工作原理、主要特點(diǎn)及其在科學(xué)研究中的應(yīng)用:
1. iTRAQ技術(shù)的工作原理
標(biāo)簽試劑結(jié)構(gòu):iTRAQ試劑由三部分組成:報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和肽反應(yīng)基團(tuán)。報(bào)告基團(tuán)的質(zhì)量分別為113Da、114Da、115Da、116Da、117Da、118Da、
119Da和121Da(對(duì)于8-plex試劑),平衡基團(tuán)則通過不同的質(zhì)量來(lái)確保所有標(biāo)記肽段在一級(jí)質(zhì)譜中具有相同的總質(zhì)量[^1^][^2^]。
一級(jí)質(zhì)譜:在不同樣本中的同一肽段被不同iTRAQ試劑標(biāo)記后,由于總質(zhì)量相同,它們?cè)谝患?jí)質(zhì)譜中表現(xiàn)為一個(gè)峰。這樣可以將不同樣本中的同一肽段在質(zhì)譜圖中
合并為一個(gè)信號(hào),簡(jiǎn)化了后續(xù)的分析。
二級(jí)質(zhì)譜:在二級(jí)質(zhì)譜分析中,iTRAQ標(biāo)簽試劑化學(xué)鍵斷裂,釋放出報(bào)告基團(tuán)的信號(hào)。這些信號(hào)的強(qiáng)度用于定量分析,而肽段碎片離子則用于定性分析。通過比較
不同報(bào)告基團(tuán)的信號(hào)強(qiáng)度,可以獲得不同樣本中相同肽段的相對(duì)定量信息。
2. iTRAQ的主要特點(diǎn)
高通量:iTRAQ技術(shù)能夠同時(shí)對(duì)多達(dá)8個(gè)樣本進(jìn)行定量分析,大大提高了實(shí)驗(yàn)通量。這使得研究者可以在單次實(shí)驗(yàn)中比較多個(gè)條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)差異。
高靈敏度:相比傳統(tǒng)的二維凝膠電泳,iTRAQ能夠檢測(cè)到更低豐度的蛋白,并且能準(zhǔn)確測(cè)量較小的蛋白變化(在1.3至1.6倍之間),從而提供了更高的靈敏度。
廣泛的應(yīng)用范圍:iTRAQ不僅能夠檢測(cè)胞漿蛋白,還能檢測(cè)膜蛋白、核蛋白等。無(wú)論是高分子量、酸性、還是堿性蛋白,iTRAQ技術(shù)都能有效地進(jìn)行鑒定。
定性與定量同步:iTRAQ技術(shù)在一次實(shí)驗(yàn)中即可完成蛋白質(zhì)的定性和定量分析,提高了實(shí)驗(yàn)效率。
3. iTRAQ技術(shù)的應(yīng)用
醫(yī)學(xué)研究:iTRAQ技術(shù)已廣泛應(yīng)用于腫瘤標(biāo)志物的篩選,通過比較腫瘤組織和正常組織的差異蛋白,研究者能夠找到潛在的診斷和治療靶標(biāo)。
藥物作用機(jī)制:利用iTRAQ技術(shù),可以篩選出與藥物作用相關(guān)的蛋白,進(jìn)而研究藥物的作用靶點(diǎn)和機(jī)制。
疾病機(jī)理研究:iTRAQ技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)生和進(jìn)展機(jī)制,發(fā)現(xiàn)新的生物學(xué)標(biāo)志物,為疾病的預(yù)防和治療提供新的思路。
綜上所述,蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)之iTRAQ在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中具有重要作用,其高通量、高靈敏度和廣泛的適用范圍使其成為研究蛋白質(zhì)表達(dá)差異的重要工具。
從醫(yī)學(xué)研究到藥物開發(fā),再到環(huán)境科學(xué),iTRAQ技術(shù)的應(yīng)用前景廣闊。研究者能夠更全面地了解蛋白質(zhì)在不同生理和病理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化,從而為生命科學(xué)研究和
相關(guān)應(yīng)用領(lǐng)域帶來(lái)新的見解和機(jī)遇。
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